Wysoka produktywność „Grube prążki”

14 Sierpnia 2022 (Ostatnia aktualizacja 22.10.2024)

Aplikacja Ssaki, genotypowanie Konstrukcja bibliotek Produktywny PCR Niskokopijne matryce, trudne próbki
Rekomendacja Titanium® Taq Advantage® 2 EmeraldAmp® Max HS TaKaRa Ex Taq®
Cecha Czułość i produktywność Długie matryce, wysoka wierność Ergonomia pracy Wysoka wierność i produktywność
Wielkość amplikonu
gDNA <2 kb <6 kb <15 kb <20 kb
Plazmid lambda <2 kb <18,5 kb ND <30 kb
cDNA <4 kb <8,5 kb ND ND
Aktywność
5’-3’ ekgzonukleazy     Tak Tak
3’-5’ ekgzonukleazy   Tak Tak Tak
Generowane końce T/A T/A T/A T/A
Formaty produktu
Premiks     Tak Dostępny
Liofilizat Dostępny Dostępny    
Kompletny PCR kit Dostępny Dostępny    
Dodany barwnik     Tak Dostępny
Hot Start Tak Tak Tak Tak

TaKaRa Titanium Taq

 

 

to niezwykły wariant polimerazy Taq z delecją na N terminalnym końcu (Barnes, 1992) i zwiększoną rozpuszczalnością. Wprowadzone modyfikacje sprawiają, że:

 

 

- możemy pracować z matrycami niskokopijnymi i otrzymujemy dużo produktu
- amplifikuje każdy DNA– wyizolowanym z baterii, plazmidowym, genomowym i cDNA

- nie trzeba optymalizować warunków reakcji – Titanium pracuje w szerokim zakresie stężenia jonów Mg2+

- otrzymujemy jeden prążek – zaopatrzenie w Hot Start niweluje powstawanie dodatkowych, niespecyficznych produktów amplifikacji

- generuje produkty do 2 kb
- Titanium jest doskonałym rozwiązaniem do reakcji typu multiplex – może pracować z tysiącami primerów jak to jest w panelach Affymetrix (CytoScan HD, CytoScan 750K Array, Genome-Wide Human SNP Array 6.0, GeneChip Human Mapping 250K/500K Array Set)
 

Produkt dostępny w różnych formatach – samej polimerazy z buforem, kompletnych kitów z kontrolami, liofilizatu (EcoDry shots), produktów klasy GMP i GPR (General Purpose Reagent). Idealny do pracy ręcznej jak i automatyzacji (również OEM)
 

Zobacz jak Titanium:
- sprawdza się w genotypowaniu i amplifikuje 9 genów z różnicami typu SNP -> Titanium Taq outperforms other polymerases in high-throughput genotyping (takarabio.com)
- pozwala wyróżnić subpopulacje komórek raka piersi -> Amplifying our understanding of breast cancer metastases (takarabio.com)  

Dostępna w wersji OEM.

Strona produktu


(katalog https://www.dropbox.com/sh/7gcxgsebzbt8w6n/AAB2NfKKRNjqYZF1_GatXFfEa/PCR?dl=0&preview=PCRBR0518_Preview.pdf&subfolder_nav_tracking=1 )

 

Advantage 2

 

 

 

 

To blend polimeraz proofreading i Titanium przez co zapewnia znakomity balans pomiędzy wierną a wysokoproduktywną reakcją PCR. Advantage 2:

 

 

 

- jest doskonałym wyborem kiedy chcemy zamplifikować wiernie matryce do analiz porównawczych lub kiedy ważna jest dla nas wierność amplifikacji np. RACE, subtraction PCR, tworzenie bibliotek DNA i cDNA.

- umożliwia amplifikację matryc do 6 kb

- pozwala na otrzymanie specyficznych wyników- jest zaopatrzona w Hot Start
- dostępna w zestawach z buforami zoptymalizowanymi do pracy z matrycami bogatymi w GC (90%); o jeszcze większej wierności i w formie liofilizatu (EcoDry shots).

Amplification with the Advantage HF 2 PCR Kit. Amplification of a wide size range of cDNA and genomic fragments. Lanes 1–3: amplification of several fragments (0.5–1.8 kb) of the human cardiac beta-myosin chain from human genomic DNA. ;Lanes 4–6: amplification of several size fragments (1.0–3.5 kb) of the BPTI gene from calf thymus DNA. Lanes 7–8: amplification from Marathon-Ready Human Placenta cDNA (Cat. No. 639311). Lane 7: 1.2-kb beta-actin fragment. Lane 8: 1.3-kb TFR fragment. Lane M: 1-kb DNA size marker.

Strona produktu

 

EmeraldAmp Max HS

 

 

 

 

polimeraza w dostarczana na wygodnym 2x zatężonym, kompletnym premiksie o pięknym szmaragdowym kolorze.
EmeraldAmp Max HS:

 

 

 

- dzięki zaopatrzeniu buforu reakcyjnego w barwnik i obciążnik znacznie przyspiesza i ułatwia pracę
- zapewnia dużą wydajność amplifikacji (10x większą niż klasyczny Taq)
- posiada aktywność proofreading, która jest rzadko spotykana w miksach tego typu

- zapewnia specyficzną amplifikację, dzięki zaopatrzeniu w Hot Start

- odpowiedni także do matryc bogatych z pary GC i AT

- generuje długie odcinki do 15 kb

- barwnik i obciążnik nie przeszkadza przy dalszej analizie miejsc cięcia enzymami restrykcyjnymi

- dobry stosunek ceny do jakości

 

Tips and FAQs Zobacz jak EmeraldAmp Max wypada:
- w porównaniu z RedTaq 0
EmeraldAmp premixes outperform MyTaq Red mix for GC-rich targets (takarabio.com) 

 

Strona produktu

 

 

TaKaRa ExTaq Polymerase

 

 

 

 

 

to blend polimeraz Takara Taq (enzymu pełnej długości) i polimerazy proofreading, przez co stanowi znacznie lepszą alternatywę dla standardowych polimeraz. Dzięki niezwykłej mieszaninie enzymów może:

 

 

 

- z wysoką wiernością generować matryce (4,5 x większą niż standardowy Taq, wg analiz metodą Kunkel)
- generować dużo produktu – „grube prążki”. Ponieważ z bezbłędnymi matrycami primery skuteczniej oddziałują, co pozwala na zabezpieczenie efektywności reakcji i wygenerowanie większej liczby kopii amplikonu w dalszych cyklach kopii. Zabezpieczenie efektywności reakcji ma duże znaczenie przy ilościowym PCR dlatego Ex Taq znajduje się w miksach do qPCR do pracy z sondami i SYBR.

- amplifikować długie i krótkie odcinki <100 bp - 30 kb

- pracować z tzw. trudnymi, pofragmentowanymi matrycami np. z bloczków parafinowych, roślin czy antycznym DNA
- generować powtarzalne wyniki – niezależnie od jakości matrycy i ilości

- generować inserty do bezpośredniego klonowania w wektory TA

W ciągu ostatnich 2 lat polimeraza Ex Taq pojawiła się w ponad 700 publikacjach.
Zawsze dostarczana z nukleotydami i buforem reakcyjnym. Dostępna również z HS i w premiksie. Liczba reakcji zawsze przeliczana na objętość 50 ul.


Dostępne formaty OEM.
Link -> Ex Taq DNA Polymerase (takarabio.com) 

 

Zobacz jak Ex Taq radzi sobie z:
- krótkimi matrycami (100 bp) -> RR001A_APP2.pdf (takarabio.com) 
- niskokopijnymi próbkami -> RR001_Taq_ExTaq_APP1.pdf (takarabio.com) 
- matrycami bogatymi w GC -> RR030_APP.pdf (takarabio.com)
- pozwala wykryć bakterie w wodzie ze zbiorników naturalnych -> Detecting infectious disease threats in a changing climate (takarabio.com)

 

Strona produktu

The amplification efficiencies of Takara Ex Taq HS DNA Polymerase and a high-grade hot start PCR enzyme from Company A were compared. A 7.5 kb target was amplified from increasing amounts of human genomic DNA template. Excellent sensitivity and yields were obtained with Takara Ex Taq HS enzyme. Lane M: Lambda-Hind III digest, Lane 1: 100 pg, Lane 2: 300 pg, Lane 3: 1 ng, Lane 4: 3 ng, Lane 5: 10 ng, Lane 6: 30 ng, Lane 7: 100 ng.


(Ex Taq DNA polymerase hot start version (takarabio.com))


(katalog https://www.dropbox.com/sh/7gcxgsebzbt8w6n/AAB2NfKKRNjqYZF1_GatXFfEa/PCR?dl=0&preview=PCRBR0518_Preview.pdf&subfolder_nav_tracking=1 )

 

To może Cię zainteresować...

LogPhase – czytnik dla mikrobiologa
LogPhase – czytnik dla mikrobiologa

LogPhase – czytnik dla mikrobiologa

Wykorzystanie mikroorganizmów leży u podstaw przemysłu biotechnologicznego. Niezależnie od tego czy mowa jest o produkcji żywności, leków, alternatywnych tworzyw syntetycznych czy biopaliw, to niezbędne jest badanie tempa i charakterystyki wzrostu drobnoustrojów.

CRISPR/Cas9 – historia, zastosowania i nowe metody syntezy ssDNA
CRISPR/Cas9 – historia, zastosowania i nowe metody syntezy ssDNA

CRISPR/Cas9 – historia, zastosowania i nowe metody syntezy ssDNA

Emmanuelle Charpentier i Jennifer A. Doudna zostały w 2020 roku uhonorowane Nagrodą Nobla w dziedzinie chemii za rozwój metody CRISPR/Cas9, nazywanej potocznie precyzyjnymi nożyczkami genetycznymi. Należy jednak pamiętać, że zainteresowanie wielu badaczy oraz jednostek naukowych na całym Świecie tym niezwykle precyzyjny narzędziem do edycji genów sięga późnych lat 80 tych XX wieku.

In-Fusion® prawdziwy kombajn w Twoim Laboratorium!
In-Fusion® prawdziwy kombajn w Twoim Laboratorium!

In-Fusion® prawdziwy kombajn w Twoim Laboratorium!

Prężny rozwój technik genetyki, biofizyki i biochemii przypadający na lata 70 XX w., pozwolił na powstaje nowej dyscypliny badawczej zwanej biologią molekularną. Jedną z technik, która zrewolucjonizowała pracę z materiałem genetycznym była opracowana w 1973 roku pierwsza metoda łączenia sek...

Zobacz wszystkie