Wysoka produktywność „Grube prążki”

Aplikacja	Ssaki, genotypowanie	Konstrukcja bibliotek	Produktywny PCR	Niskokopijne matryce, trudne próbki
Rekomendacja	Titanium® Taq	Advantage® 2	EmeraldAmp® Max HS	TaKaRa Ex Taq®
Cecha	Czułość i produktywność	Długie matryce, wysoka wierność	Ergonomia pracy	Wysoka wierność i produktywność
Wielkość amplikonu
gDNA	<2 kb	<6 kb	<15 kb	<20 kb
Plazmid lambda	<2 kb	<18,5 kb	ND	<30 kb
cDNA	<4 kb	<8,5 kb	ND	ND
Aktywność
5’-3’ ekgzonukleazy			Tak	Tak
3’-5’ ekgzonukleazy		Tak	Tak	Tak
Generowane końce	T/A	T/A	T/A	T/A
Formaty produktu
Premiks			Tak	Dostępny
Liofilizat	Dostępny	Dostępny
Kompletny PCR kit	Dostępny	Dostępny
Dodany barwnik			Tak	Dostępny
Hot Start	Tak	Tak	Tak	Tak

TaKaRa Titanium Taq

 

 

to niezwykły wariant polimerazy Taq z delecją na N terminalnym końcu (Barnes, 1992) i zwiększoną rozpuszczalnością. Wprowadzone modyfikacje sprawiają, że:

 

 

- możemy pracować z matrycami niskokopijnymi i otrzymujemy dużo produktu
- amplifikuje każdy DNA– wyizolowanym z baterii, plazmidowym, genomowym i cDNA

- nie trzeba optymalizować warunków reakcji – Titanium pracuje w szerokim zakresie stężenia jonów Mg2+

- otrzymujemy jeden prążek – zaopatrzenie w Hot Start niweluje powstawanie dodatkowych, niespecyficznych produktów amplifikacji

- generuje produkty do 2 kb
- Titanium jest doskonałym rozwiązaniem do reakcji typu multiplex – może pracować z tysiącami primerów jak to jest w panelach Affymetrix (CytoScan HD, CytoScan 750K Array, Genome-Wide Human SNP Array 6.0, GeneChip Human Mapping 250K/500K Array Set)
 

Produkt dostępny w różnych formatach – samej polimerazy z buforem, kompletnych kitów z kontrolami, liofilizatu (EcoDry shots), produktów klasy GMP i GPR (General Purpose Reagent). Idealny do pracy ręcznej jak i automatyzacji (również OEM)
 

Zobacz jak Titanium: - sprawdza się w genotypowaniu i amplifikuje 9 genów z różnicami typu SNP -> Titanium Taq outperforms other polymerases in high-throughput genotyping (takarabio.com) - pozwala wyróżnić subpopulacje komórek raka piersi -> Amplifying our understanding of breast cancer metastases (takarabio.com)

Dostępna w wersji OEM.

Strona produktu

(katalog https://www.dropbox.com/sh/7gcxgsebzbt8w6n/AAB2NfKKRNjqYZF1_GatXFfEa/PCR?dl=0&preview=PCRBR0518_Preview.pdf&subfolder_nav_tracking=1 )

 

Advantage 2

 

 

 

 

To blend polimeraz proofreading i Titanium przez co zapewnia znakomity balans pomiędzy wierną a wysokoproduktywną reakcją PCR. Advantage 2:

 

 

 

- jest doskonałym wyborem kiedy chcemy zamplifikować wiernie matryce do analiz porównawczych lub kiedy ważna jest dla nas wierność amplifikacji np. RACE, subtraction PCR, tworzenie bibliotek DNA i cDNA.

- umożliwia amplifikację matryc do 6 kb

- pozwala na otrzymanie specyficznych wyników- jest zaopatrzona w Hot Start
- dostępna w zestawach z buforami zoptymalizowanymi do pracy z matrycami bogatymi w GC (90%); o jeszcze większej wierności i w formie liofilizatu (EcoDry shots).

Amplification with the Advantage HF 2 PCR Kit. Amplification of a wide size range of cDNA and genomic fragments. Lanes 1–3: amplification of several fragments (0.5–1.8 kb) of the human cardiac beta-myosin chain from human genomic DNA. ;Lanes 4–6: amplification of several size fragments (1.0–3.5 kb) of the BPTI gene from calf thymus DNA. Lanes 7–8: amplification from Marathon-Ready Human Placenta cDNA (Cat. No. 639311). Lane 7: 1.2-kb beta-actin fragment. Lane 8: 1.3-kb TFR fragment. Lane M: 1-kb DNA size marker.

Strona produktu

 

EmeraldAmp Max HS

 

 

 

 

polimeraza w dostarczana na wygodnym 2x zatężonym, kompletnym premiksie o pięknym szmaragdowym kolorze.
EmeraldAmp Max HS:

 

 

 

- dzięki zaopatrzeniu buforu reakcyjnego w barwnik i obciążnik znacznie przyspiesza i ułatwia pracę
- zapewnia dużą wydajność amplifikacji (10x większą niż klasyczny Taq)
- posiada aktywność proofreading, która jest rzadko spotykana w miksach tego typu

- zapewnia specyficzną amplifikację, dzięki zaopatrzeniu w Hot Start

- odpowiedni także do matryc bogatych z pary GC i AT

- generuje długie odcinki do 15 kb

- barwnik i obciążnik nie przeszkadza przy dalszej analizie miejsc cięcia enzymami restrykcyjnymi

- dobry stosunek ceny do jakości

 

Zobacz jak EmeraldAmp Max wypada: - w porównaniu z RedTaq 0 EmeraldAmp premixes outperform MyTaq Red mix for GC-rich targets (takarabio.com)

 

Strona produktu

 

 

TaKaRa ExTaq Polymerase

 

 

 

 

 

to blend polimeraz Takara Taq (enzymu pełnej długości) i polimerazy proofreading, przez co stanowi znacznie lepszą alternatywę dla standardowych polimeraz. Dzięki niezwykłej mieszaninie enzymów może:

 

 

 

- z wysoką wiernością generować matryce (4,5 x większą niż standardowy Taq, wg analiz metodą Kunkel)
- generować dużo produktu – „grube prążki”. Ponieważ z bezbłędnymi matrycami primery skuteczniej oddziałują, co pozwala na zabezpieczenie efektywności reakcji i wygenerowanie większej liczby kopii amplikonu w dalszych cyklach kopii. Zabezpieczenie efektywności reakcji ma duże znaczenie przy ilościowym PCR dlatego Ex Taq znajduje się w miksach do qPCR do pracy z sondami i SYBR.

- amplifikować długie i krótkie odcinki <100 bp - 30 kb

- pracować z tzw. trudnymi, pofragmentowanymi matrycami np. z bloczków parafinowych, roślin czy antycznym DNA
- generować powtarzalne wyniki – niezależnie od jakości matrycy i ilości

- generować inserty do bezpośredniego klonowania w wektory TA

W ciągu ostatnich 2 lat polimeraza Ex Taq pojawiła się w ponad 700 publikacjach.
Zawsze dostarczana z nukleotydami i buforem reakcyjnym. Dostępna również z HS i w premiksie. Liczba reakcji zawsze przeliczana na objętość 50 ul.

Dostępne formaty OEM.
Link -> Ex Taq DNA Polymerase (takarabio.com) 

 

Zobacz jak Ex Taq radzi sobie z: - krótkimi matrycami (100 bp) -> RR001A_APP2.pdf (takarabio.com)  - niskokopijnymi próbkami -> RR001_Taq_ExTaq_APP1.pdf (takarabio.com)  - matrycami bogatymi w GC -> RR030_APP.pdf (takarabio.com) - pozwala wykryć bakterie w wodzie ze zbiorników naturalnych -> Detecting infectious disease threats in a changing climate (takarabio.com)

 

Strona produktu

The amplification efficiencies of Takara Ex Taq HS DNA Polymerase and a high-grade hot start PCR enzyme from Company A were compared. A 7.5 kb target was amplified from increasing amounts of human genomic DNA template. Excellent sensitivity and yields were obtained with Takara Ex Taq HS enzyme. Lane M: Lambda-Hind III digest, Lane 1: 100 pg, Lane 2: 300 pg, Lane 3: 1 ng, Lane 4: 3 ng, Lane 5: 10 ng, Lane 6: 30 ng, Lane 7: 100 ng.

(Ex Taq DNA polymerase hot start version (takarabio.com))

(katalog https://www.dropbox.com/sh/7gcxgsebzbt8w6n/AAB2NfKKRNjqYZF1_GatXFfEa/PCR?dl=0&preview=PCRBR0518_Preview.pdf&subfolder_nav_tracking=1 )