Platforma SmartChip Real-Time PCR

22 Sierpnia 2023 (Ostatnia aktualizacja 22.10.2024)

System do wysokoprzepustowej analizy qPCR oraz RT-qPCR

Real-time PCR (qPCR) to potężna technika genotypowania i analizy ekspresji genów. Obecnie eksperymenty qPCR stają się coraz bardziej złożone – analizowanych jest wiele genów w całych paletach próbek. Aby nie popełnić błędów technicznych w tak czułej analizie często wykonuje się je nawet w triplikatach. Często specjaliści określają normy i ścisłe wytyczne w przeprowadzaniu takich analiz, dokładają dodatkowe kontrole i zalecenia przeprowadzania oraz porównywania wyników pomiędzy oznaczeniami. W związku z tym powstaje zwiększone zapotrzebowanie na wysokoprzepustowe rozwiązania o wysokiej wydajności, czułości, specyficzności i powtarzalności.

Więcej o qPCR możecie przeczytać TU.


Platforma SmartChip Real-Time PCR System to kompletne rozwiązanie, umożliwiające wydajne i wysokoprzepustowe przeprowadzenie reakcji real-time PCR zapewniając niezrównany poziom elastyczności analizy i układu eksperymentalnego.
SmartChip umożliwia także przeprowadzenie analiz typu SNP i RT-qPCR.

Fig1.Schemat protokoły reakcyjnego z użyciem SmartChip MyDesign Kit oraz platformy SmartChip RealTime PCR System

W nieco ponad 2 godziny SmartChip Real-Time PCR Cycler może nastawić 5 184 równoległych reakcji. Platforma jest otwarta, dzięki czemu zapewnia elastyczność w zakresie używanych odczynników oraz zapewnia znaczące ograniczenie ich zużycia zmniejszając objętość reakcji do 100 nl (=0,1 ul).

Fig.2 Zapewnij sobie możliwość otrzymania spójnej, miarodajnej analizy multigenowej bez utraty elastyczności

Dużą zaletą systemu SmartChip jest chip reakcyjny składający się z 5 184 pojedynczych nanodołków, w których mogą zachodzić reakcje (SmartChip MyDesign Kit). Zapewnia to dużą elastyczność przy konstruowaniu analizy. Można przeprowadzić badanie 384 analizując 12 sekwencji lub przeprowadzić analizę multigenową (384 sekwencje) w 12 próbkach zachowując te same warunki i kontrole reakcji. System umożliwia przeprowadzenie 14 różnych wariacji próbka/sekwencja (tabela powyżej).

Fig.3 Zachowaj wydajność bez rezygnacji z czułości analizy qPCR

System SmartChip umożliwia wykonywanie reakcji w 100-nl, co przekłada się na znaczną oszczędność odczynników i środków w porównaniu z reakcjami 25 µl na płytkach 384-dołkowych. Reakcje w 100-nl reakcje, wymagają tylko 3-10 ng/μl materiału (RNA/DNA), aby przeprowadzić czułą analizę, bez potrzeby wstępnej amplifikacji. W porównaniu do systemu IFC, SmartChip Real-Time PCR jest optymalniejszym rozwiązaniem, gdyż ten pierwszy mimo przeprowadzania reakcji w mniejszej objętości 10 µl wymaga większej ilości materiału do reakcji 60 ng/μl (preamplifikacji).

Analizę ekspresji genów można przeprowadzić zarówno przy użyciu metod opartych na barwnikach jak i na sondach, w zależności od potrzeb badawczych.

Fig.4 Platforma SmartChip Real-Time PCR

System składa się z Nanodyspensera (na lewo) oraz SmartChip Real-time termocyklera (na prawo)
Nanodyspenser umożliwia naniesienie próbek w wysoką precyzją i nanolitrową dokłdnością. W przeciągu 40 min przygotowuje 100 nl mieszaninę reakcyjną w 5184 nanodołkach.
SmartChip Real-time termocykler pozwala na przeprowadzenie analizy z różnymi barwnikami (FAM, VIC, ROX i SYBR) umożliwiając pracę zarówno z sondami jak i w systemie interkalującym. Analiza wyników trwa 2h i możliwa jest do przeprowadzenia w załączonym oprogramowaniu.

Platforma zaopatrzona jest w SmartChip MultiSample NanoDispenser (MSND), który bardzo precyzyjnie dozuje odczynniki oraz próbki na chip reakcyjny. Komora dyspensyjna zapewnia odpowiednią temperaturę i nawilżenie otoczenia zmniejszając ryzyko wyparowania reagentów.

Fig.5 Wykonuj czułe, dokładne i spójne genotypowanie nawet dla próbek o stężeniu jak małym jak 1 ng/µl

System SmartChip zapewnia bardzo dokładną i czułą analizę, co ma kluczowe znaczenie dla wykonywania dokładnych badań podczas genotypowania. Obrazy powyżej przedstawiają wyniki z genotypowania tych samych próbek w różnym rozcieńczeniu 1 ng/µl (panel A) i 5 ng/µl (panel B) były badane w systemie SmartChip przy użyciu tego samego testu genotypowania. Chociaż próbki bardziej rozcieńczone 1 ng/µl są bardziej rozproszone na wykresie, nadal możliwe jest ich przyporządkowanie  do określonej grupy.

Fig.6 Platforma SmartChip zapewnia wysoce powtarzalne pomiary ekspresji genów w szerokim zakresie dynamicznym (6-log)

Lewy wykres pokazuje sporządzoną krzywa dla punktów 10^0 do 10^6 (6-log) z DNA faga lambda. Platforma SmartChip zapewnia czułą detekcję i umożliwia dokonanie analizy ekspresji genów w szerokim zakresie dynamicznym detekcji z wysoką wartością korelacji R2 >0,99.
Prawy wykres to zestawienie analiz trzech różnych użytkowników platformy SmartChip, którzy przeprowadzili ten sam test ekspresji genów na dwóch różnych chipach w trzy różne dni. Krzywe pokazują spójność i powtarzalność otrzymanych danych (R2 >0,98) dla porównań między chipami, operatorami oraz dniami.

Zobacz zastosowanie platformy SmarChip przy badaniu lekooporności.

Broszura
Specyfikacja

640022 SmartChip® Real-Time PCR System Each
640032 SmartChip® MyDesign Kit (430-000110) 1 chip
640036 SmartChip® MyDesign Kit (430-000244) 20/Pack

 

 

To może Cię zainteresować...

Komórki pierwotne krwi
Komórki pierwotne krwi

Komórki pierwotne krwi

STEMCELL Technologies dostarcza szeroką gamę wysokiej jakości pierwotnych komórek ludzkich, które są kluczowym narzędziem dla naukowców prowadzących badania w dziedzinie biologii komórkowej, immunologii, onkologii, neurologii, a także medycyny regeneracyjnej. Komórki te są izolowane bezpośrednio z tkanek, co zapewnia ich fizjologiczne właściwości i umożliwia prowadzenie badań o wysokiej trafności biologicznej.

Nowe spojrzenie na stłuszczeniową chorobę wątroby
Nowe spojrzenie na stłuszczeniową chorobę wątroby

Nowe spojrzenie na stłuszczeniową chorobę wątroby

Zapoznaj się z nową terminologią i dowiedz się, dlaczego dokładne rozróżnienie MASLD i MASH jest kluczowe dla opracowania strategii terapeutycznych mających na celu ograniczenie ryzyka wystąpienia poważniejszych powikłań. Sprawdź w jakie narzędzia badawcze możemy Cię wyposażyć oraz poznaj nową opcję leczenia farmakologicznego.

POROZMAWIAJMY O EDYCJI!
POROZMAWIAJMY O EDYCJI!

POROZMAWIAJMY O EDYCJI!

Czym jest edycja genów? Do czego jest nam potrzebna? I dlaczego może zrewolucjonizować nasze życie? Najprościej rzecz ujmując, edycja genów to proces modyfikacji materiału genetycznego organizmów w celu poprawy ich cech lub leczenia chorób genetycznych. Narzędzia edycji genów pozwalają na precyzyjne wprowadzanie zmian w sekwencji DNA, co otwiera nowe możliwości w medycynie, rolnictwie i badaniach biologicznych.

Zobacz wszystkie