Szybki PCR – „Spieszy mi się”

12 Sierpnia 2022 (Ostatnia aktualizacja 22.10.2024)

Aplikacja Klonowanie, sekwencjonowanie  Kolonijny PCR Szybka reakcji Bezpośredni PCR z próbki bez izolacji DNA
Rekomendacja PrimeSTAR MAX SapphireAmp Fast
PCR Master Mix
SpeedSTAR HS
DNA Polymerase
Terra PCR Direct
Polymerase Mix
Cecha Szybki, wygodny premiks, najwyższa wierność Szybki premiks,rutynowy PCR Szybka reakcja z podwyższoną wiernością Szybka reakcja, matryce bogate w GC
Wielkość amplikonu
gDNA <6 kb <6 kb <20 kb <2 kb
Plazmid lambda <15 kb <5 kb <20 kb  
cDNA <6 kb      
Aktywność
5’-3’ ekgzonukleazy    Tak Tak  
3’-5’ ekgzonukleazy Tak Tak Tak  
Generowane końce  Tępe końce T/A T/A T/A
Szybkość 5 sec/kb 10 sec/kb 10 sec/kb 60 sec/kb
Matryce bogate w GC       70%
Formaty produktu
Premiks Tak Tak   Dostępny
Kit z barwnikiem i obciążnikiem   Tak   Dostępny
Hot Start Tak Tak Tak Tak
pcr success

PrimeSTAR MAX

 

 

 

 

 

Aktualnie najwierniejsza polimeraza w portfolio. Popełnia 1 błąd na 45 tyś par zasad na matrycy bogatej w GC. Wynik ten został ustalony na podstawie sekwencjonowania, czyli w najbardziej bezpośredni możliwy sposób. PrimeSTAR MAX zapewnia:

- niezrównaną wierność i specyficzność amplifikacji. Polimeraza zawiera hot start.

- szybką amplifikację (5 sek/kb)

- ergonomię i łatwość pracy dzięki gotowemu, zoptymalizowanemu premiksowi (2x)

- matryce idealne do klonowania (wierność biologiczna), tworzenia bibliotek

- możliwość analiz typu SNP, struktury i funkcji cząsteczek 

 

 

 

 

 

 

Zobacz jak PrimeSTAR MAX pozwala zamplifikować różne matryce z wysoką wiernością
Fast and accurate PCR (takarabio.com)

 

Strona produktu

 

 

pcr success

 

SapphireAmp Fast PCR Master Mix

 

 

Został stworzony do wykonywania kolonijnego PCR łatwo, szybko. Doskonale sprawdza się w wysokoprzepustowych analizach klonów. Premiks (2x) poza dNTP, buforem, polimerazą Hot Start i niezbędnymi jonami, zawiera w składzie także niebieski barwnik z obciążnikiem, umożliwiający sprawne nakładanie próbki bezpośrednio z PCRówki na żel. Znacznie skraca procedurę poprzez wyeliminowanie etapu przygotowania próbki. Sama reakcja PCR jest bardzo szybka (10 sec/kb) co również przekłada się na oszczędność czasu podczas analizy. 

 

 

SapphireAmp Fast PCR Master Mix pozwala na:

- szybką analizę nawet dużej liczby wyrośniętych kolonii w około 1 h (wysokoprzepustową analizę)

- przeprowadzenie reakcji PCR nawet z małej próbki kolonii i wygodne naniesienie produktów na żel

- amplifikację długich insertów (~6 kb)

- pewną analizę obecności insertu, dzięki zaopatrzeniu polimerazy w HS a przez to brak niespecyficznej amplifikacji

- reakcję cięcia amplikonów restryktazami w miksie reakcyjnym bez konieczności ich izolacji

 

Figure 1. Colony PCR protocol with SapphireAmp Fast PCR Master Mix. 

 

 

 

Zobacz jak Master Mix SapphireAmp szybko, łatwo i wygodnie pozwoli na przeprowadzenie kolonijnego PCR
Colony PCR: Protocol complete in under an hour (takarabio.com)

 

Strona produktu

 

 

pcr success

 

SpeedSTAR HS DNA Polymerase

 

 

Polimeraza odznaczająca się niezwykłą szybkością działania (10 sek/kb) a przez to polecana do rutynowych analiz. W porównaniu do polimerazy Taq przyspiesza proces 6x i nie wymaga do tego celu termocyklerów z wysoką dynamiką bloku grzewczego. Zaopatrzona w dwa bufory umożliwia amplifikację matryc o szerokim spektrum długości -nawet do 20 kb. 

 

 

SpeedSTAR HS DNA Polymerase zapewnia możliwość:

  • szybkiej analizy zgromadzonych próbek (reakcja amplifikacji 20 kb odcinka zajmuje ok 4 minuty) 
  • specyficznej analizy dzięki zaopatrzeniu w HS
  • amplifikacji długich matryc (<20 kb)

 

 

Zobacz jak SpeedSTAR HS DNA polymerase znajduje zastosowanie w szybkiej identyfikacji śladów DNA z miejsc przestępstwa
Faster PCR means faster forensic analysis

Strona produktu

 

pcr success

 

Terra PCR Direct Polymerase Mix

 

 

  Terra to linia niezwykłych produktów umożliwiających genotypowanie DNA bezpośrednio z próbki. Dostępne są różne formaty produktu, zestawione poniżej w tabeli.
Doskonale sprawdzają się one z próbkami środowiskowymi, ale także w pracy z tkankami i płynami biologicznymi jak np. krew. Dzięki zastosowaniu niezwykłej polimerazy odpornej na inhibitory reakcji PCR udało się uprościć proces analizy oraz nie wymaga on ściśle kontrolowanych warunków i wyizolowanej matrycy. Wysoka czułość enzymu z kolei pozwala na pracę z DNA uwolnionym podczas lizy termicznej z komórek. Polimeraza Terra amplifikuje odcinki do 2 kb. Fragmenty bogate w GC (70%) nie stanowią problemu co czyni ją świetnym narzędziem zarówno w bardziej wymagających aplikacjach jak i rutynowej, szybkiej analizie. 

 

 

Terra PCR direct umożliwia:

- znaczne przyspieszenie protokołu reakcyjnego i łatwość analizy poprzez całkowitą eliminację etapu izolacji DNA z próbki

- przeprowadzenie direct PCR z próbek środowiskowych, krwi, tkanek, komórek, kolonii bakteryjnych/grzybowych, roślin, owadów, FFPE, FTA

- pracę z trudnymi i niskokopijnymi matrycami 

- specyficzną reakcje amplifikacji dzięki zaopatrzeniu w Hot Start

- powielanie matryc bogatych w GC (70%, 2 kb)

 

 

 

Przykładowy materiał, który został wykorzystany z sukcesem do genotypowania z użyciem polimerazy Terra. 

Zachęcamy do zapoznania się z broszurą.

 

 

 

 

Formaty I aplikacje  zestawów. 

 

 

 

Zobacz jak polimeraza Terra:
- pozwala odkryć co kryje się w DNA z paznokci
Direct PCR from human nail DNA sample (takarabio.com)
- pozwala na genotypowanie próbek wprost z mięsa
Direct PCR from meat samples (takarabio.com)

 

Faster DNA amplification with the Terra PCR Direct FFPE Kit

 

Faster DNA amplification with the Terra PCR Direct FFPE Kit. The Terra FFPE Kit and a competitor's kit were both used to amplify fragments of the GAPDH gene from FFPE rat leg. Lanes 1: 152 bp fragment. Lanes 2: 193 bp fragment. Lanes 3: 429 bp fragment. Lanes M: 100 bp ladder.

Strona produktu

 

To może Cię zainteresować...

EPOCH 2 - starszy brat o większych możliwościach
EPOCH 2 - starszy brat o większych możliwościach

EPOCH 2 - starszy brat o większych możliwościach

Spektrofotometry mikropłytkowe, czyli czytniki płytek do pomiaru absorbancji oparte o monochromator, na stałe zadomowiły się w polskich laboratoriach. Mimo, że czytniki filtrowe, takie jak 800 TS, wciąż znajdują swoich odbiorców, to dla większości Użytkowników spektrofotometr będzie bardziej uniwersalnym wyborem.

LogPhase – czytnik dla mikrobiologa
LogPhase – czytnik dla mikrobiologa

LogPhase – czytnik dla mikrobiologa

Wykorzystanie mikroorganizmów leży u podstaw przemysłu biotechnologicznego. Niezależnie od tego czy mowa jest o produkcji żywności, leków, alternatywnych tworzyw syntetycznych czy biopaliw, to niezbędne jest badanie tempa i charakterystyki wzrostu drobnoustrojów.

CRISPR/Cas9 – historia, zastosowania i nowe metody syntezy ssDNA
CRISPR/Cas9 – historia, zastosowania i nowe metody syntezy ssDNA

CRISPR/Cas9 – historia, zastosowania i nowe metody syntezy ssDNA

Emmanuelle Charpentier i Jennifer A. Doudna zostały w 2020 roku uhonorowane Nagrodą Nobla w dziedzinie chemii za rozwój metody CRISPR/Cas9, nazywanej potocznie precyzyjnymi nożyczkami genetycznymi. Należy jednak pamiętać, że zainteresowanie wielu badaczy oraz jednostek naukowych na całym Świecie tym niezwykle precyzyjny narzędziem do edycji genów sięga późnych lat 80 tych XX wieku.

Zobacz wszystkie