Fragmenty bogate w pary GC – „GC- Rich”

11 Sierpnia 2022 (Ostatnia aktualizacja 22.10.2024)

Aplikacja Kłopotliwe genotypowanie  Amplifikacja długich odcinków, sekwencjonowanie, klonowanie NGS
Rekomendacja Advantage GC 2  TaKaRa LA Taq z buforem GC PrimeSTAR® GXL
Cecha Wysoka zawartość GC w matrycy Generacja długich odcinków bogatych w GC Wysoka wierność
Wielkość amplikonu
gDNA <3,5 kb <17,5 kb <30 kb
Plazmid lambda <6 kb <35 kb <40 kb
cDNA <2 kb   <13,5 kb
Aktywność
5’-3’ ekgzonukleazy    Tak  
3’-5’ ekgzonukleazy Tak Tak Tak
Generowane końce  T/A T/A Tępe końce
Wierność Wierna Wierniejsza Najwierniejsza
Szybkość 60 sec/kb 60 sec/kb 10 sec/kb
Matryce bogate w GC < 90% <74% <73%
Formaty produktu
Kit z kontrolami Dostępny Dostępny  
Hot Start     Tak

Advantage GC 2 Polymerase Mix

 

 

To blend polimeraz proofreading i Titanium przez co zapewnia znakomity balans pomiędzy wierną a wysokoproduktywną reakcją PCR. Ponad to format GC zawiera dodatkowy reagent GC-Melt oraz DMSO, które pozwalają na powielenie matryc nawet w 90% złożonych z GC. 

 

 


Advantage GC 2:

- jest doskonałym wyborem kiedy chcemy zamplifikować cDNA bogate w pary GC. Jeśli matrycą jest ssacze gDNA polecamy Advantage GC Genomic LA Polymerase Mix generującą dłuższe fragmenty (48 kb). 

- umożliwia amplifikację matryc do 3,5 kb z podwyższoną wiernością.

- zapewnia dobrą produktywność na złożonych matrycach dzięki zawartość GC-Melt Reagent oraz zoptymalizowanemu buforowi z DMSO.
- dostępna w zestawach z komponentami reakcji i kontrolami.

Advantage GC 2 successfully amplifies GC-rich targets. A 510 bp portion of IGFR II cDNA, containing a 110 bp region with a GC content of 90%, was amplified from Human Placenta Marathon-Ready cDNA (Cat. No. 639311) using the following: Advantage 2 + 6% DMSO + 0.1 M GC-Melt (Lane 1); Advantage 2 + 1.0 M GC-Melt (Lane 2); Advantage GC 2 + 1.0 M GC-Melt (Lane 3); and Advantage 2 + 5% DMSO (Lane 4). Lane M: DNA size marker.

Strona produktu-> Advantage GC 2 products (takarabio.com)

 

 

TaKaRa LA Taq DNA Polymerase with GC Buffers

 

 

LA taq to jedna z najbardziej popularnych polimeraz Takara – ponad 3 tyś publikacji, składa się z blendu polimeraz – enzymu pełnej długości TaKaRa Taq oraz proofreading z aktywnością egzonukleazy 3’-5’. Formuła z buforem GC pozwala ponad to na amplifikację nie tylko długich odcinków ze zwiększoną wiernością ale i bogatych w pary GC zwiększając uniwersalność tego rozwiązania.  

 

 

TaKaRa LA Taq z GC buffer umożliwia:

- powielenie długich, złożnych martyc o strukturach wyższego rzędu (73% GC), dzięki systemowi dwóch buforów. Buffer I jest doskonały przy amplifikacji złożonych dłuższych matryc (≥5 kb), buffer II do krótszych (2-3 kb) 

- zwiększoną wierność amplifikacji w porównaniu do polimerazy Taq

- wysoką produktywność bez konieczności optymalizacji

Amplification of the Huntington's Disease (HD) gene using Takara LA Taq DNA Polymerase. The HD gene is GC-rich and highly repetitive and the primers used in this experiment amplified regions of the HD gene IT15 CAG repeat. For all reactions, purified human genomic DNA (100 ng in a 50 µL reaction) was used as a template in reactions containing Takara LA Taq polymerase with either LA PCR Buffer II (lane 1), GC Buffer I (lane 2), or GC Buffer II (lane 3), or a competitor's high GC DNA polymerase kit (lane 4). The sizes of the amplified products were 262 bp (GC content 73%) and 358 bp (GC content 71.5%). Lane M contains a 100 bp ladder.

 

 

Zobacz jak polimeraza TaKaRa LA Taq:
- pozwala zamplifikować długie matryce-> https://www.takarabio.com/learning-centers/pcr/technical-notes/long-range-pcr-with-la-taq#experiment1 
- pozwala zidentyfikować czemu leopardy zamieniają się w czarne pantery- How the leopard lost its spots

Strona produktu 

 

 

PrimeSTAR GXL

 

 

Polimeraza archeobakteryjna, pełnej długości zaopatrzona w czynnik elongacyjny i hot start. Skrót GXL pochodzi od fraz GC-rich sequences, eXcess template present, Long amplicons. PrimeSTAR GXL zapewnia:

 

 

  • możliwość powielania matryc bogatych w pary GC (73%)
  • specyficzną pracę pomimo dużego stężenia DNA
  • przeprowadzenia long PCR do 30 kb (gDNA)
  • szybką amplifikację (10 sek/kb), co skraca procedury zwłaszcza przy LA PCR
  • wierną amplifikację bez dołączania końców TA
  • brak generacji niespecyficznych produktów, dzięki zaopatrzeniu w hot start 
  • możliwość generacji matryc z przeznaczeniem do sekwencjonowania NGS m.in. na Nanopore, typowania HLA
  • ergonomię pracy dzięki wersji w premiksie 

 

PCR product Zobacz jak PrimeSTAR GXL:
- amplifikuje matryce bogate w pary GC -> https://www.takarabio.com/learning-centers/pcr/technical-notes/amplifying-gc-rich-templates
-amplifikuje złożone matryce do sekwencjonowania -> https://www.takarabio.com/learning-centers/pcr/technical-notes/primestar-gxl-for-targeted-sequencing 
- pomaga w walce z wirusem Epstein-Barr -> https://www.takarabio.com/about/bioview-blog/cancer-research/when-epstein-barr-virus-becomes-a-chronic-menace
- umożliwia sklonowanie ciężkiego łańcucha przeciwciała za pomocą megaprimera ->
https://www.takarabio.com/learning-centers/pcr/technical-notes/megaprimer-pcr-with-primestar-gxl
- pomaga wykrywać mozajcyzm somatyczny-> https://www.takarabio.com/learning-centers/pcr/technical-notes/detecting-somatic-mosaicism-using-massively-parallel-sequencing 

 


Dostępna w wersji OEM.

Strona produktu 

 

To może Cię zainteresować...

Komórki pierwotne krwi
Komórki pierwotne krwi

Komórki pierwotne krwi

STEMCELL Technologies dostarcza szeroką gamę wysokiej jakości pierwotnych komórek ludzkich, które są kluczowym narzędziem dla naukowców prowadzących badania w dziedzinie biologii komórkowej, immunologii, onkologii, neurologii, a także medycyny regeneracyjnej. Komórki te są izolowane bezpośrednio z tkanek, co zapewnia ich fizjologiczne właściwości i umożliwia prowadzenie badań o wysokiej trafności biologicznej.

Nowe spojrzenie na stłuszczeniową chorobę wątroby
Nowe spojrzenie na stłuszczeniową chorobę wątroby

Nowe spojrzenie na stłuszczeniową chorobę wątroby

Zapoznaj się z nową terminologią i dowiedz się, dlaczego dokładne rozróżnienie MASLD i MASH jest kluczowe dla opracowania strategii terapeutycznych mających na celu ograniczenie ryzyka wystąpienia poważniejszych powikłań. Sprawdź w jakie narzędzia badawcze możemy Cię wyposażyć oraz poznaj nową opcję leczenia farmakologicznego.

POROZMAWIAJMY O EDYCJI!
POROZMAWIAJMY O EDYCJI!

POROZMAWIAJMY O EDYCJI!

Czym jest edycja genów? Do czego jest nam potrzebna? I dlaczego może zrewolucjonizować nasze życie? Najprościej rzecz ujmując, edycja genów to proces modyfikacji materiału genetycznego organizmów w celu poprawy ich cech lub leczenia chorób genetycznych. Narzędzia edycji genów pozwalają na precyzyjne wprowadzanie zmian w sekwencji DNA, co otwiera nowe możliwości w medycynie, rolnictwie i badaniach biologicznych.

Zobacz wszystkie