Fragmenty bogate w pary GC – „GC- Rich”

Aplikacja	Kłopotliwe genotypowanie	Amplifikacja długich odcinków, sekwencjonowanie, klonowanie	NGS
Rekomendacja	Advantage GC 2	TaKaRa LA Taq z buforem GC	PrimeSTAR® GXL
Cecha	Wysoka zawartość GC w matrycy	Generacja długich odcinków bogatych w GC	Wysoka wierność
Wielkość amplikonu
gDNA	<3,5 kb	<17,5 kb	<30 kb
Plazmid lambda	<6 kb	<35 kb	<40 kb
cDNA	<2 kb		<13,5 kb
Aktywność
5’-3’ ekgzonukleazy		Tak
3’-5’ ekgzonukleazy	Tak	Tak	Tak
Generowane końce	T/A	T/A	Tępe końce
Wierność	Wierna	Wierniejsza	Najwierniejsza
Szybkość	60 sec/kb	60 sec/kb	10 sec/kb
Matryce bogate w GC	< 90%	<74%	<73%
Formaty produktu
Kit z kontrolami	Dostępny	Dostępny
Hot Start			Tak

Advantage GC 2 Polymerase Mix

 

 

To blend polimeraz proofreading i Titanium przez co zapewnia znakomity balans pomiędzy wierną a wysokoproduktywną reakcją PCR. Ponad to format GC zawiera dodatkowy reagent GC-Melt oraz DMSO, które pozwalają na powielenie matryc nawet w 90% złożonych z GC. 

 

 

Advantage GC 2:

- jest doskonałym wyborem kiedy chcemy zamplifikować cDNA bogate w pary GC. Jeśli matrycą jest ssacze gDNA polecamy Advantage GC Genomic LA Polymerase Mix generującą dłuższe fragmenty (48 kb). 

- umożliwia amplifikację matryc do 3,5 kb z podwyższoną wiernością.

- zapewnia dobrą produktywność na złożonych matrycach dzięki zawartość GC-Melt Reagent oraz zoptymalizowanemu buforowi z DMSO.
- dostępna w zestawach z komponentami reakcji i kontrolami.

Advantage GC 2 successfully amplifies GC-rich targets. A 510 bp portion of IGFR II cDNA, containing a 110 bp region with a GC content of 90%, was amplified from Human Placenta Marathon-Ready cDNA (Cat. No. 639311) using the following: Advantage 2 + 6% DMSO + 0.1 M GC-Melt (Lane 1); Advantage 2 + 1.0 M GC-Melt (Lane 2); Advantage GC 2 + 1.0 M GC-Melt (Lane 3); and Advantage 2 + 5% DMSO (Lane 4). Lane M: DNA size marker.

Strona produktu-> Advantage GC 2 products (takarabio.com)

 

 

TaKaRa LA Taq DNA Polymerase with GC Buffers

 

 

LA taq to jedna z najbardziej popularnych polimeraz Takara – ponad 3 tyś publikacji, składa się z blendu polimeraz – enzymu pełnej długości TaKaRa Taq oraz proofreading z aktywnością egzonukleazy 3’-5’. Formuła z buforem GC pozwala ponad to na amplifikację nie tylko długich odcinków ze zwiększoną wiernością ale i bogatych w pary GC zwiększając uniwersalność tego rozwiązania.  

 

 

TaKaRa LA Taq z GC buffer umożliwia:

- powielenie długich, złożnych martyc o strukturach wyższego rzędu (73% GC), dzięki systemowi dwóch buforów. Buffer I jest doskonały przy amplifikacji złożonych dłuższych matryc (≥5 kb), buffer II do krótszych (2-3 kb) 

- zwiększoną wierność amplifikacji w porównaniu do polimerazy Taq

- wysoką produktywność bez konieczności optymalizacji

Amplification of the Huntington's Disease (HD) gene using Takara LA Taq DNA Polymerase. The HD gene is GC-rich and highly repetitive and the primers used in this experiment amplified regions of the HD gene IT15 CAG repeat. For all reactions, purified human genomic DNA (100 ng in a 50 µL reaction) was used as a template in reactions containing Takara LA Taq polymerase with either LA PCR Buffer II (lane 1), GC Buffer I (lane 2), or GC Buffer II (lane 3), or a competitor's high GC DNA polymerase kit (lane 4). The sizes of the amplified products were 262 bp (GC content 73%) and 358 bp (GC content 71.5%). Lane M contains a 100 bp ladder.

 

 

Zobacz jak polimeraza TaKaRa LA Taq:
- pozwala zamplifikować długie matryce-> https://www.takarabio.com/learning-centers/pcr/technical-notes/long-range-pcr-with-la-taq#experiment1 
- pozwala zidentyfikować czemu leopardy zamieniają się w czarne pantery- How the leopard lost its spots

Strona produktu 

 

 

PrimeSTAR GXL

 

 

Polimeraza archeobakteryjna, pełnej długości zaopatrzona w czynnik elongacyjny i hot start. Skrót GXL pochodzi od fraz GC-rich sequences, eXcess template present, Long amplicons. PrimeSTAR GXL zapewnia:

 

 

• możliwość powielania matryc bogatych w pary GC (73%)
• specyficzną pracę pomimo dużego stężenia DNA
• przeprowadzenia long PCR do 30 kb (gDNA)
• szybką amplifikację (10 sek/kb), co skraca procedury zwłaszcza przy LA PCR
• wierną amplifikację bez dołączania końców TA
• brak generacji niespecyficznych produktów, dzięki zaopatrzeniu w hot start 
• możliwość generacji matryc z przeznaczeniem do sekwencjonowania NGS m.in. na Nanopore, typowania HLA
• ergonomię pracy dzięki wersji w premiksie 

 

Zobacz jak PrimeSTAR GXL: - amplifikuje matryce bogate w pary GC -> https://www.takarabio.com/learning-centers/pcr/technical-notes/amplifying-gc-rich-templates -amplifikuje złożone matryce do sekwencjonowania -> https://www.takarabio.com/learning-centers/pcr/technical-notes/primestar-gxl-for-targeted-sequencing  - pomaga w walce z wirusem Epstein-Barr -> https://www.takarabio.com/about/bioview-blog/cancer-research/when-epstein-barr-virus-becomes-a-chronic-menace - umożliwia sklonowanie ciężkiego łańcucha przeciwciała za pomocą megaprimera -> https://www.takarabio.com/learning-centers/pcr/technical-notes/megaprimer-pcr-with-primestar-gxl - pomaga wykrywać mozajcyzm somatyczny-> https://www.takarabio.com/learning-centers/pcr/technical-notes/detecting-somatic-mosaicism-using-massively-parallel-sequencing

 

Dostępna w wersji OEM.

Strona produktu