Szybki PCR – „Spieszy mi się”
| Aplikacja | Klonowanie, sekwencjonowanie | Kolonijny PCR | Szybka reakcji | Bezpośredni PCR z próbki bez izolacji DNA |
| Rekomendacja | PrimeSTAR MAX | SapphireAmp Fast PCR Master Mix | SpeedSTAR HS DNA Polymerase | Terra PCR Direct Polymerase Mix |
| Cecha | Szybki, wygodny premiks, najwyższa wierność | Szybki premiks,rutynowy PCR | Szybka reakcja z podwyższoną wiernością | Szybka reakcja, matryce bogate w GC |
| Wielkość amplikonu | ||||
| gDNA | <6 kb | <6 kb | <20 kb | <2 kb |
| Plazmid lambda | <15 kb | <5 kb | <20 kb | |
| cDNA | <6 kb | |||
| Aktywność | ||||
| 5’-3’ ekgzonukleazy | Tak | Tak | ||
| 3’-5’ ekgzonukleazy | Tak | Tak | Tak | |
| Generowane końce | Tępe końce | T/A | T/A | T/A |
| Szybkość | 5 sec/kb | 10 sec/kb | 10 sec/kb | 60 sec/kb |
| Matryce bogate w GC | 70% | |||
| Formaty produktu | ||||
| Premiks | Tak | Tak | Dostępny | |
| Kit z barwnikiem i obciążnikiem | Tak | Dostępny | ||
| Hot Start | Tak | Tak | Tak | Tak |
PrimeSTAR MAX
Aktualnie najwierniejsza polimeraza w portfolio. Popełnia 1 błąd na 45 tyś par zasad na matrycy bogatej w GC. Wynik ten został ustalony na podstawie sekwencjonowania, czyli w najbardziej bezpośredni możliwy sposób. PrimeSTAR MAX zapewnia:
– niezrównaną wierność i specyficzność amplifikacji. Polimeraza zawiera hot start.
– szybką amplifikację (5 sek/kb)
– ergonomię i łatwość pracy dzięki gotowemu, zoptymalizowanemu premiksowi (2x)
– matryce idealne do klonowania (wierność biologiczna), tworzenia bibliotek
– możliwość analiz typu SNP, struktury i funkcji cząsteczek
Zobacz jak PrimeSTAR MAX pozwala zamplifikować różne matryce z wysoką wiernością
Fast and accurate PCR (takarabio.com)
SapphireAmp Fast PCR Master Mix
Został stworzony do wykonywania kolonijnego PCR łatwo, szybko. Doskonale sprawdza się w wysokoprzepustowych analizach klonów. Premiks (2x) poza dNTP, buforem, polimerazą Hot Start i niezbędnymi jonami, zawiera w składzie także niebieski barwnik z obciążnikiem, umożliwiający sprawne nakładanie próbki bezpośrednio z PCRówki na żel. Znacznie skraca procedurę poprzez wyeliminowanie etapu przygotowania próbki. Sama reakcja PCR jest bardzo szybka (10 sec/kb) co również przekłada się na oszczędność czasu podczas analizy.
SapphireAmp Fast PCR Master Mix pozwala na:
– szybką analizę nawet dużej liczby wyrośniętych kolonii w około 1 h (wysokoprzepustową analizę)
– przeprowadzenie reakcji PCR nawet z małej próbki kolonii i wygodne naniesienie produktów na żel
– amplifikację długich insertów (~6 kb)
– pewną analizę obecności insertu, dzięki zaopatrzeniu polimerazy w HS a przez to brak niespecyficznej amplifikacji
– reakcję cięcia amplikonów restryktazami w miksie reakcyjnym bez konieczności ich izolacji
Zobacz jak Master Mix SapphireAmp szybko, łatwo i wygodnie pozwoli na przeprowadzenie kolonijnego PCR
Colony PCR: Protocol complete in under an hour (takarabio.com)
SpeedSTAR HS DNA Polymerase
Polimeraza odznaczająca się niezwykłą szybkością działania (10 sek/kb) a przez to polecana do rutynowych analiz. W porównaniu do polimerazy Taq przyspiesza proces 6x i nie wymaga do tego celu termocyklerów z wysoką dynamiką bloku grzewczego. Zaopatrzona w dwa bufory umożliwia amplifikację matryc o szerokim spektrum długości -nawet do 20 kb.
SpeedSTAR HS DNA Polymerase zapewnia możliwość:
- szybkiej analizy zgromadzonych próbek (reakcja amplifikacji 20 kb odcinka zajmuje ok 4 minuty)
- specyficznej analizy dzięki zaopatrzeniu w HS
- amplifikacji długich matryc (<20 kb)
Zobacz jak SpeedSTAR HS DNA polymerase znajduje zastosowanie w szybkiej identyfikacji śladów DNA z miejsc przestępstwa
Faster PCR means faster forensic analysis
Terra PCR Direct Polymerase Mix
Terra to linia niezwykłych produktów umożliwiających genotypowanie DNA bezpośrednio z próbki. Dostępne są różne formaty produktu, zestawione poniżej w tabeli.
Doskonale sprawdzają się one z próbkami środowiskowymi, ale także w pracy z tkankami i płynami biologicznymi jak np. krew. Dzięki zastosowaniu niezwykłej polimerazy odpornej na inhibitory reakcji PCR udało się uprościć proces analizy oraz nie wymaga on ściśle kontrolowanych warunków i wyizolowanej matrycy. Wysoka czułość enzymu z kolei pozwala na pracę z DNA uwolnionym podczas lizy termicznej z komórek. Polimeraza Terra amplifikuje odcinki do 2 kb. Fragmenty bogate w GC (70%) nie stanowią problemu co czyni ją świetnym narzędziem zarówno w bardziej wymagających aplikacjach jak i rutynowej, szybkiej analizie.
Terra PCR direct umożliwia:
– znaczne przyspieszenie protokołu reakcyjnego i łatwość analizy poprzez całkowitą eliminację etapu izolacji DNA z próbki
– przeprowadzenie direct PCR z próbek środowiskowych, krwi, tkanek, komórek, kolonii bakteryjnych/grzybowych, roślin, owadów, FFPE, FTA
– pracę z trudnymi i niskokopijnymi matrycami
– specyficzną reakcje amplifikacji dzięki zaopatrzeniu w Hot Start
– powielanie matryc bogatych w GC (70%, 2 kb)
Przykładowy materiał, który został wykorzystany z sukcesem do genotypowania z użyciem polimerazy Terra.
Zachęcamy do zapoznania się z broszurą.
Formaty I aplikacje zestawów.
Zobacz jak polimeraza Terra:
– pozwala odkryć co kryje się w DNA z paznokci
Direct PCR from human nail DNA sample (takarabio.com)
– pozwala na genotypowanie próbek wprost z mięsa
Direct PCR from meat samples (takarabio.com)
Faster DNA amplification with the Terra PCR Direct FFPE Kit. The Terra FFPE Kit and a competitor’s kit were both used to amplify fragments of the GAPDH gene from FFPE rat leg. Lanes 1: 152 bp fragment. Lanes 2: 193 bp fragment. Lanes 3: 429 bp fragment. Lanes M: 100 bp ladder.
