GeneQuery
10 Grudnia 2019 (Ostatnia aktualizacja 22.10.2024)
Zestawy macierzy GeneQuery™ qPCR to starannie opracowane narzędzie, które umożliwia analizę ekspresji genów w szybki i oszczędny sposób. Dobór genów, w każdym rodzaju zestawu oparty jest wnikliwych i regularnych badaniach literatury przeprowadzonych przez zespół specjalistów ScienCell. Zestawy są dostarczane w formacie płytki 96-dołkowej do qPCR. Każdy dołek zawiera jeden zestaw starterów, który swoiście rozpoznaje i wydajnie amplifikuje cDNA genu docelowego.
Kluczowe zalety analizy ekspresji genów zestawami GeneQuery™
- primery dla ponad 4.000 genów
- docelowy gen wykrywany i określany ilościowo przy bardzo niskiej liczbie kopii
- amplpifikacja dotyczy wyłącznie badanego genu, produktem jest amplikon o wielkości 80-210 bp
- zestaw starterów rozpoznawał wszystkie znane warianty transkrypcyjne genu docelowego (o ile nie wskazano inaczej)
- wysoka wydajność; produkt podwaja się z każdym cyklem w fazie wykładniczej
- wysoka powtarzalność
- gotowe zestawy predefiniowane oraz pod indywidualne zamówienie
- bezpośredni pomiar ekspresji genów w różnego typu komórkach, liniach komórkowych bądź tkankach
- porównywanie wyników porównanie międzylaboratoryjne i między różnymi testami, ponieważ wszystkie primery są optymalizowane w tych samych warunkach qPCR
- optymalna temperatura anilingu w reakcji qPCR wynosiła 65 °C (przy 2 mM Mg2+ i bez DMSO)
- brak problemu primer-dimer
- zestaw starterów walidowany za pomocą qPCR z analizą krzywej topnienia i elektroforezą żelową
- dostępne na życzenie zestawy na mysz, szczura, świnię
- większość zestawów dostępna wyłącznie w ScienCell
Analiza ekspresji genów zestawami GeneQuery™ dotyczyć może
- komórki systemu nerwowego
- komórki płucne
- komórki nerkowe
- komórki tarczycy
- komórki nabłonkowe
- hepatocyty
- komórki śródbłonka
- fibroblasty
- komórki macierzyste
- … szereg innych
szlaków biologicznych
- szlak PD-1/PD-L1
- szlak sygnalizacyjny Wnt
- szlak sygnalizacyjnyNotch
- angiogeneza
- apoptoza
- cykl komórkowy
- … szereg innych
chorób
- rak tarczycy
- rak wątrobowokomórkowy
- rak nerkowokomórkowy
- czerniak
- rak płuc
- zapalenie wątroby typu B
- wirusowe zapalenie wątroby typu C
- stwardnienie zanikowe boczne (ALS)
- … szereg innych
Szerokie zastosowanie zestawów do analiza ekspresji genów GeneQuery™
Badania podstawowe- analiza szlaków biologicznych
- identyfikacja zakłóceń sygnalizacji komórkowej
- badanie zmian ekspresji genów
- badania nad rakiem
- badania chorób dziedzicznych
- badanie mechanizmów, które mogą charakteryzować fenotypy
- porównanie funkcji i biologii komórki w różnych warunkach
Badania translacyjne
- poszukiwanie i ocena markerów biologii eksperymentalnej
- ocena mechanizmu działania leku w badaniach przesiewowych
- ocena działania nowego leku i ulepszanie jego działania
- badania metabolizmu leków
Badania kliniczne
- przewidywanie skuteczność leku u poszczególnych pacjentów
- ocena efektów terapii skojarzonej
- ocena zgodności i bezpieczeństwa stosowania leku
Zestaw przykładowy GeneQuery™ Human Skin Wound Healing qPCR Array Kit, #GK041
Zestaw ten ma na celu ułatwienie profilowania ekspresji 88 kluczowych genów zaangażowanych w proces naprawy ran. Gojenie ran jest złożonym procesem, który obejmuje wiele zdarzeń biologicznych, takich jak fagocytoza, angiogeneza, neokolageneza, rekonstrukcja nabłonka i remodeling kolagenu.
Można go ogólnie podzielić na 3 etapy: 1) hemostazę i koagulację, 2) zapalenie i 3) proliferację i przebudowę tkanek.
Geny pogrupowane zgodnie z ich funkcjami analizowane zestawem #GK041
- Etapy gojenia się ran
- Hemostaza i koagulacja: IL1A, IL1B, IL6, TNF, FGF2, IGF1, TGF, HIF1A
- Zapalenie: CXCL8, VEGF, ELANE, CTSG, PRTN3, PLAU, TGF, PDGF, TNF, IFNG
- Proliferacja i przebudowa tkanek: EGF, FGF7, IGF1, IFNG, CSK, RAC1, RHOA, CDC42
- Składniki zewnątrzkomórkowej macierzy: COL1A2, COL3A1, COL4A1, COL14A1
- Adhezja komórkowa: CDH1, ITGA, ITGB, MMP, F3, FGA, TIMP1, ACTA2, ACTC1, TAGLN
- Cytokiny i chemokiny: CCL2, CXCL1, CXCL2, CXCL8, IL1A, IL1B, IL4, IL6
- Czynniki wzrostu: CSF2, CSF3, EGF, CTGF, FGF, PDGF, TGF
