GeneQuery

Zestawy macierzy GeneQuery™ qPCR to starannie opracowane narzędzie, które umożliwia  analizę ekspresji genów w szybki i oszczędny sposób. Dobór genów, w każdym rodzaju zestawu oparty jest wnikliwych i regularnych badaniach literatury przeprowadzonych przez zespół specjalistów ScienCell. Zestawy są dostarczane w formacie płytki 96-dołkowej do qPCR. Każdy dołek zawiera jeden zestaw starterów, który swoiście rozpoznaje i wydajnie amplifikuje cDNA genu docelowego.

Kluczowe zalety analizy ekspresji genów zestawami GeneQuery™

• primery dla ponad 4.000 genów
• docelowy gen wykrywany i określany ilościowo przy bardzo niskiej liczbie kopii
• amplpifikacja dotyczy wyłącznie badanego genu, produktem jest amplikon o wielkości 80-210 bp
•   zestaw starterów rozpoznawał wszystkie znane warianty transkrypcyjne genu docelowego (o ile nie wskazano inaczej)

• wysoka wydajność; produkt podwaja się z każdym cyklem w fazie wykładniczej
• wysoka powtarzalność
• gotowe zestawy predefiniowane oraz pod indywidualne zamówienie
• bezpośredni pomiar ekspresji genów w różnego typu komórkach, liniach komórkowych bądź tkankach
• porównywanie wyników porównanie międzylaboratoryjne i między różnymi testami, ponieważ wszystkie primery są optymalizowane w tych samych warunkach qPCR
• optymalna temperatura anilingu w reakcji qPCR wynosiła 65 °C (przy 2 mM Mg²⁺ i bez DMSO)
• brak problemu primer-dimer
• zestaw starterów walidowany za pomocą qPCR z analizą krzywej topnienia i elektroforezą żelową
• dostępne na życzenie zestawy na mysz, szczura, świnię
• większość zestawów dostępna wyłącznie w ScienCell

Analiza ekspresji genów zestawami GeneQuery™ dotyczyć może

 

 

systemów komórkowych

•  komórki systemu nerwowego
•   komórki płucne
•   komórki nerkowe
•   komórki tarczycy
•   komórki nabłonkowe
•   hepatocyty
•   komórki śródbłonka
•   fibroblasty
•   komórki macierzyste
•   … szereg innych

 

szlaków biologicznych

•   szlak PD-1/PD-L1
•   szlak sygnalizacyjny Wnt
•   szlak sygnalizacyjnyNotch
•   angiogeneza
•   apoptoza
•   cykl komórkowy
•   … szereg innych

 

chorób

•   rak tarczycy
•   rak wątrobowokomórkowy
•   rak nerkowokomórkowy
•   czerniak
•   rak płuc
•   zapalenie wątroby typu B
•   wirusowe zapalenie wątroby typu C
•   stwardnienie zanikowe boczne (ALS)
•   … szereg innych

 

 

Szerokie zastosowanie zestawów do analiza ekspresji genów GeneQuery™

Badania podstawowe

• analiza szlaków biologicznych
• identyfikacja zakłóceń sygnalizacji komórkowej
• badanie zmian ekspresji genów
• badania nad rakiem
• badania chorób dziedzicznych
• badanie mechanizmów, które mogą charakteryzować fenotypy
• porównanie funkcji i biologii komórki w różnych warunkach

 

 

 

Badania translacyjne

•   poszukiwanie i ocena markerów biologii eksperymentalnej
•   ocena mechanizmu działania leku w badaniach przesiewowych
•   ocena działania nowego leku i ulepszanie jego działania
•   badania metabolizmu leków

 

 

 

Badania kliniczne

• przewidywanie skuteczność leku u poszczególnych pacjentów
• ocena efektów terapii skojarzonej
• ocena zgodności i bezpieczeństwa stosowania leku

 

Zestaw przykładowy GeneQuery™ Human Skin Wound Healing qPCR Array Kit, #GK041

Zestaw ten ma na celu ułatwienie profilowania ekspresji 88 kluczowych genów zaangażowanych w proces naprawy ran. Gojenie ran jest złożonym procesem, który obejmuje wiele zdarzeń biologicznych, takich jak fagocytoza, angiogeneza, neokolageneza, rekonstrukcja nabłonka i remodeling kolagenu.

Można go ogólnie podzielić na 3 etapy: 1) hemostazę i koagulację, 2) zapalenie i 3) proliferację i przebudowę tkanek.
Geny pogrupowane zgodnie z ich funkcjami analizowane zestawem #GK041

• Etapy gojenia się ran
• Hemostaza i koagulacja: IL1A, IL1B, IL6, TNF, FGF2, IGF1, TGF, HIF1A
• Zapalenie: CXCL8, VEGF, ELANE, CTSG, PRTN3, PLAU, TGF, PDGF, TNF, IFNG
• Proliferacja i przebudowa tkanek: EGF, FGF7, IGF1, IFNG, CSK, RAC1, RHOA, CDC42
• Składniki zewnątrzkomórkowej macierzy: COL1A2, COL3A1, COL4A1, COL14A1
• Adhezja komórkowa: CDH1, ITGA, ITGB, MMP, F3, FGA, TIMP1, ACTA2, ACTC1, TAGLN
• Cytokiny i chemokiny: CCL2, CXCL1, CXCL2, CXCL8, IL1A, IL1B, IL4, IL6
• Czynniki wzrostu: CSF2, CSF3, EGF, CTGF, FGF, PDGF, TGF